Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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