Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM43BQ6ZT52 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms