Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL1Q5VZK9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL1Q5VZK9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms