Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM69BQ5VUD6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms