Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms