Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms