Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDGFRLQ15198 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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