Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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