Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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