Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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