Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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CNTN1Q12860 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CNTN1Q12860 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN1Q12860 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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