Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3C1Q12789 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GTF3C1Q12789 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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