Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNB2Q08289 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB2Q08289 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms