Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms