Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms