Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTCQ00610 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms