Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTBP2P56545 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms