Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms