Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI2P48788 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI2P48788 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI2P48788 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI2P48788 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI2P48788 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI2P48788 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI2P48788 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI2P48788 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI2P48788 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI2P48788 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNNI2P48788 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI2P48788 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI2P48788 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI2P48788 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI2P48788 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms