Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms