Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBRP36941 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBRP36941 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBRP36941 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBRP36941 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBRP36941 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBRP36941 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBRP36941 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBRP36941 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms