Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms