Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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