Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms