Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRMP28827 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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