Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms