Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms