Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HRCP23327 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HRCP23327 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HRCP23327 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HRCP23327 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms