Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms