Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB9P17482 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms