Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms