Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM1B2RUZ4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms