Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K4Q9Y6R4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms