Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP16Q9Y5T5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms