Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms