Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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NFE2L3Q9Y4A8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NFE2L3Q9Y4A8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NFE2L3Q9Y4A8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NFE2L3Q9Y4A8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NFE2L3Q9Y4A8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NFE2L3Q9Y4A8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFE2L3Q9Y4A8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFE2L3Q9Y4A8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFE2L3Q9Y4A8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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