Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF8Q9UPP1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms