Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms