Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms