Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms