Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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