Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms