Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPJQ9HC77 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms