Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms