Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCAPERQ9BY12 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms