Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms