Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3Q99687 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms