Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms