Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTV1Q96GA3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTV1Q96GA3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms