Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms